Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms