Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 LITAF-203ENST00000413364 2292 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms