Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms