Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms