Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGMNQ99538 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LGMNQ99538 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LGMNQ99538 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
LGMNQ99538 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LGMNQ99538 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms