Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms