Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms