Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLMNQ96JQ2 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms