Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
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