Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms