Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms