Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms