Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms