Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms