Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CD163Q86VB7 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CD163Q86VB7 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CD163Q86VB7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CD163Q86VB7 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CD163Q86VB7 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CD163Q86VB7 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CD163Q86VB7 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CD163Q86VB7 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CD163Q86VB7 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CD163Q86VB7 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CD163Q86VB7 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CD163Q86VB7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CD163Q86VB7 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CD163Q86VB7 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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CD163Q86VB7 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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