Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ATG4DQ86TL0 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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