Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms