Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms