Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms