Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms