Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TYW3Q6IPR3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TYW3Q6IPR3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TYW3Q6IPR3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TYW3Q6IPR3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TYW3Q6IPR3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TYW3Q6IPR3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TYW3Q6IPR3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TYW3Q6IPR3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TYW3Q6IPR3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TYW3Q6IPR3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TYW3Q6IPR3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TYW3Q6IPR3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TYW3Q6IPR3 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TYW3Q6IPR3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TYW3Q6IPR3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TYW3Q6IPR3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TYW3Q6IPR3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TYW3Q6IPR3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TYW3Q6IPR3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TYW3Q6IPR3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TYW3Q6IPR3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TYW3Q6IPR3 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TYW3Q6IPR3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TYW3Q6IPR3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TYW3Q6IPR3 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TYW3Q6IPR3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TYW3Q6IPR3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TYW3Q6IPR3 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TYW3Q6IPR3 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TYW3Q6IPR3 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TYW3Q6IPR3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms