Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.55
SUMO4Q6EEV6 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SUMO4Q6EEV6 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SUMO4Q6EEV6 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SUMO4Q6EEV6 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SUMO4Q6EEV6 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SUMO4Q6EEV6 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SUMO4Q6EEV6 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SUMO4Q6EEV6 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SUMO4Q6EEV6 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SUMO4Q6EEV6 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SUMO4Q6EEV6 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SUMO4Q6EEV6 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SUMO4Q6EEV6 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SUMO4Q6EEV6 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SUMO4Q6EEV6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SUMO4Q6EEV6 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SUMO4Q6EEV6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SUMO4Q6EEV6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms