Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms