Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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PDSS1Q5T2R2 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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