Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms