Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms