Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 359.1 ms