Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LITAF-221ENST00000622633 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TMPRSS13-205ENST00000526090 2592 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms