Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms