Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
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CCDC96Q2M329 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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CCDC96Q2M329 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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CCDC96Q2M329 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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CCDC96Q2M329 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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CCDC96Q2M329 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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CCDC96Q2M329 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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CCDC96Q2M329 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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CCDC96Q2M329 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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CCDC96Q2M329 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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CCDC96Q2M329 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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