Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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PTPROQ16827 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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PTPROQ16827 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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PTPROQ16827 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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PTPROQ16827 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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PTPROQ16827 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
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