Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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