Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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