Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SNAPC1Q16533 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SNAPC1Q16533 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SNAPC1Q16533 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SNAPC1Q16533 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SNAPC1Q16533 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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