Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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DDB1Q16531 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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DDB1Q16531 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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DDB1Q16531 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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DDB1Q16531 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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DDB1Q16531 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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DDB1Q16531 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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DDB1Q16531 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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DDB1Q16531 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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