Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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RPE65Q16518 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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RPE65Q16518 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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RPE65Q16518 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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RPE65Q16518 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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