Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
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GRIK4Q16099 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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