Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
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