Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPTX1Q15818 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NPTX1Q15818 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NPTX1Q15818 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPTX1Q15818 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NPTX1Q15818 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NPTX1Q15818 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NPTX1Q15818 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NPTX1Q15818 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NPTX1Q15818 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPTX1Q15818 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPTX1Q15818 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPTX1Q15818 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NPTX1Q15818 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NPTX1Q15818 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NPTX1Q15818 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NPTX1Q15818 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPTX1Q15818 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPTX1Q15818 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NPTX1Q15818 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NPTX1Q15818 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NPTX1Q15818 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NPTX1Q15818 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NPTX1Q15818 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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NPTX1Q15818 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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NPTX1Q15818 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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