Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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