Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms