Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRRQ15256 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRRQ15256 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRRQ15256 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRRQ15256 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRRQ15256 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRRQ15256 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRRQ15256 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRRQ15256 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRRQ15256 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRRQ15256 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRRQ15256 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRRQ15256 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRRQ15256 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRRQ15256 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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PTPRRQ15256 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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PTPRRQ15256 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRRQ15256 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRRQ15256 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRRQ15256 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRRQ15256 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRRQ15256 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRRQ15256 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRRQ15256 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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PTPRRQ15256 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRRQ15256 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRRQ15256 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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PTPRRQ15256 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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PTPRRQ15256 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRRQ15256 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRRQ15256 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRRQ15256 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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PTPRRQ15256 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRRQ15256 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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PTPRRQ15256 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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PTPRRQ15256 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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PTPRRQ15256 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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PTPRRQ15256 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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PTPRRQ15256 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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PTPRRQ15256 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRRQ15256 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRRQ15256 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRRQ15256 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRRQ15256 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRRQ15256 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRRQ15256 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRRQ15256 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRRQ15256 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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