Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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