Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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