Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
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