Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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