Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA7Q13683 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms