Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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