Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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PPP1R1AQ13522 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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PPP1R1AQ13522 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PPP1R1AQ13522 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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