Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AC009088.1-201ENST00000565152 833 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AL669831.3-208ENST00000634337 891 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AC090373.1-201ENST00000623955 603 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms